مرت الكنيسة بمراحل تناسب إجمالاً مراحل التاريخ العام. وقد قسّم المؤلفان المطران ميشيل يستيم والأرشمندريت اغناطيوس ديك تاريخها إلى خمسة عصور متميزة، توافق الأحداث الهامة في الشرق. فيتحدث الكتاب:
عن الكنيسة في عهد الامبراطورية الوثنية.
الكنيسة في عهد الامبراطورية المسيحية.
الكنيسة منذ ظهور الاسلام حتى حملات الفرنجة.
الكنيسة منذ غزو الفرنجة حتى الفتح العثماني من آخر القرن الحادي عشر حتى مطلع القرن السادس عشر.
الكنيسة منذ الفتح العثماني والإصلاح حتى هذا اليوم. كتاب تاريخ الكنيسة الشرقية وأهم أحداث الكنيسة الغربية من منشورات معهد القديس بولس للفلسفة واللاهوت - حريصا، والمكتبة البولسية.